Der Aufsichtsrat der NADA setzt sich zusammen aus hochrangigen Vertretern aus Politik, Sport und Gesellschaft. Er tagt in der Regel dreimal im Jahr und kontrolliert den Vorstand der NADA. Der Aufsichtsrat der NADA besteht aus mindestens neun Personen. Dem Aufsichtsrat gehören an:

Prof. Hans Georg Näder (Geschäftsführender Gesellschafter der Otto Bock Firmengruppe)

1. der Präsident des Deutschen Olympischen Sportbundes oder eine von ihm benannte Person, die Mitglied des Präsidiums des Deutschen Olympischen Sportbundes sein soll. Dieser ist vertreten durch Dr. Michael Vesper (Generaldirektor des Deutschen Olympischen Sportbundes),

2. der Vorsitzende der Ständigen Konferenz der Spitzenverbände oder eine von ihm benannte Person aus der Ständigen Konferenz der Spitzenverbände. Dieser ist vertreten durch Rainer Brechtken (Präsident des Deutschen Turner-Bundes),

3. eine vom Beirat der Aktiven des Deutschen Olympischen Sportbundes benannte Person. Dieser ist vertreten durch Silke Kassner (Athletenkommission im Deutschen Olympischen Sportbund),

4. der Bundesminister des Innern oder eine von ihr benannte Person des Ministeriums. Dieser ist vertreten durch Gerhard Böhm (Ministerialdirektor, Abteilungsleiter Sport des Bundesministerium des Innern),

5. die Vorsitzende des Sportausschusses des Deutschen Bundestages oder ein vom Ausschuss benanntes Mitglied des Sportausschusses. Dieser ist vertreten durch Dagmar Freitag (Mitglied des Deutschen Bundestages (MdB), Vorsitzende des Sportausschusses),

6. der Vorsitzende der Sportministerkonferenz der Länder oder eine von ihm benannte Person aus der Sportministerkonferenz. Diese ist vertreten durch Boris Rhein (Hessischer Staatsminister des Innern und für Sport),

7. drei weitere, von den geborenen Aufsichtsratsmitgliedern (Nr. 1-6) zu berufende Aufsichtsratsmitglieder, die nicht den unter den Ziffern 1-6 genannten Institutionen angehören dürfen, sondern insbesondere aus dem Bereich der Wirtschaft und der Wissenschaft stammen sollen, wobei Vertreter/innen aus an der Stiftung finanziell beteiligten Unternehmen besonders berücksichtigt werden sollen. Dazu gehören derzeit Prof. Hans Georg Näder als Aufsichtsratsvorsitzender (Geschäftsführender Gesellschafter der Otto Bock Firmengruppe) und Dr. Michael Ilgner (Vorstandsvorsitzender der Stiftung Deutsche Sporthilfe).

8. Der Aufsichtsrat kann die Vorsitzenden der Kommission der NADA als beratende Mitglieder ohne Stimmrecht in den Aufsichtsrat berufen. Berufen sind derzeit Armin Baumert (Leiter der Kommission Doping-Kontroll-System), Dr. Sebastian Thormann (Leiter der Kommission Medizin), Prof. Dr. Rudhard Klaus Müller (Leiter der Kommission Medizin) und Prof. Dr. Martin Nolte (Leiter der Kommission Recht).